Octave

Octave : Basic Operation

a = pi;
disp(a);  // 3.1416

A = [1 2; 3 4; 5 6];  // matrix

B = 1:2:10;  // matrix [1 3 5 7 9]

C = 1:5;  // matrix [1 2 3 4 5]

D = ones(2, 3);  // 2*3 matrix with all 1s

E = zeros(2, 2);  // 2*2 matrix with all 0s

F = rand(1, 3);  // 1*3 matrix with each random numbers

hist(A);  // show histogram of A

G = eye(6);  // 6*6 identity matrix

help rand;  // get documentation of rand

Octave : Moving Data Around

  • size : Find the size of any matrix :

    A = [1 2; 3 4; 5 6];
size(A);  // 3  2

  • length : Find the length of any vector (or matrix's longest side) :

    length(A);  // 3
B = [1 2 3 4];
length(B);  // 4

  • 可以使用 Linux 相關語法

    • pwd, ls, cd ...

  • load : 載入文件

    load featuresX.dat
load('priceY.dat')

  • who : 可以查看目前所有變數

  • whos : who + details

    Attr Name       Size                     Bytes  Class
==== ====       ====                     =====  =====
    A           3x2                         48  double
    B           1x4                         32  double

  • save : 可以將變數另存成新檔 (存放地點可用 pwd 查)

    save record.txt A;
save record.mat B;

  • clear : 清空所有變數

矩陣操作

A=[123456]A = \begin{bmatrix}1&2\\3&4\\5&6\end{bmatrix}

  • 冒號的用途

    A(:,2);  // 把每一列的第二個叫出來

prints :
2
4
6

A([1, 3], :);  // 列出第一跟三列的所有東西

prints:
1  2
5  6

  • 可以修改特定行或列

    A(:, 2) = [10; 11; 12];  // 修改每一列的第二個

prints:
1  10
3  11
5  12

  • 可以插入特定行或列

    A(:, 3) = [100; 101; 102];  // 將 vector 插入第三行
A = [A, [1000; 1001; 1002]];  // 將 vector append 到最後一行

  • matrix 強制轉成 vector

    A(:);

prints:
1
3
5
10
11
12
100
101
102
1000
1001
1002

  • 合併矩陣

    A = [1 2; 3 4; 5 6];
B = [11 12; 13 14; 15 16];

C = [A, B];  // or [A B]

prints:
1  2  11  12
3  4  13  14
5  6  15  16

D = [A; B];

prints:
1  2
3  4
5  6
11  12
13  14
15  16

Octave : Computing on Data

假設我們有以下三個矩陣 :

A=[123456],B=[111213141516],C=[1122]A = \begin{bmatrix}1&2\\3&4\\5&6\end{bmatrix}, B = \begin{bmatrix}11&12\\13&14\\15&16\end{bmatrix}, C = \begin{bmatrix}1&1\\2&2\end{bmatrix}

  • 矩陣相乘

    A * C

  • Element-wise

    • 相乘

      • 會將矩陣每一個對應的位子相乘

        ``` matlab

        A .* B

    prints: 11 24 39 56 75 96

    * Power
``` matlab
A .^ 2

prints:
1   4
9  16
25  36

    • Divide

      ``` matlab

      1 ./ A

    prints: 1.00000 0.50000 0.33333 0.25000 0.20000 0.16667

    ```

  • 幾乎每個數學式都可以直接跟矩陣一起運作

    • abs

      ``` matlab

      abs([-1;2;-3])

    prints: 1 2 3

    * negative
``` matlab
v = [-1;2;-3]
-v

prints:
1
-2
3

    • addition

      ``` matlab

      v + 1

    prints: 2 3 4

    * floor
``` matlab
a = [1, 15, 2, 0.5]
floor(a)

prints:
1  15  2  0

    • ceil

      ``` matlab

      a = [1, 15, 2, 0.5]

      ceil(a)

    prints: 1 15 2 1

    ```

  • 對矩陣操作

    • sum

      ``` matlab

      a = [1 2; 3 4];

      sum(a)

      sum(a(:))

    prints: 4 6 10

    * sum with row and column
``` matlab
A = [1 2; 1 2];

sum(A, 1)  // 等於 sum(A) 求出每個 column 相加

prints: 
2  4

sum(A, 2)  // 求出每個 row 相加

prints:
3
3

    • prod

      ``` matlab

      a = [1 2; 3 4];

      prod(a)

      prod(a(:))

    prints: 3 8 24

    * comparison
``` matlab
a = [1 2 3 4]
a < 3

prints:
1  1  0  0

    • max

      ``` matlab

      a = [1 2 3 4]

      max(a) // prints: 4

    [val, index] = max(a)

    prints: val = 4 index = 4

    * max with n*n matrix
``` matlab
A =
8  1  6
3  5  7
4  9  2

max(A, [], 1)  // 會 print 出每 column 最大的，跟預設的 max(A) 一樣

prints:
8  9  7

max(A, [], 2)  // 會 print 出每 row 最大的

prints:
8
7
9

    • find

      ``` matlab

      find(a < 3)

    prints: 1 2

    * find with row & column
``` matlab
A = magic(3)  // magic(n) 可以產生 n*n 的矩陣，row 和 column 和 diagonal 的 sum 都一樣

prints:
8   1   6
3   5   7
4   9   2

[r, c] = find(D >= 7)

prints:
r =
1
3
2

c =
1
2
3

// means (1, 1), (3, 2), (2, 3)

  • 矩陣運算

    • Transpose

      ``` matlab

      A'

    prints: 1 3 5 2 4 6

    * Inverse
``` matlab
pinv(A)

Octave : Plotting Data

  • 以下介紹一些函數來讓 data 視覺化

  • 假設我們有以下的 variables

    t = [0:0.01:1];
y1 = sin(2*pi*4*t);
y2 = cos(2*pi*4*t);
A = magic(5);

  • plot(x, y) : 可以生成 x-y 圖表

    plot(t, y1);

    • 要同時 show 出兩個圖表在同一張上

      plot(t, y1);
hold on;
plot(t, y2);

    • 可以對圖表做一些標記

      xlabel("Time");
ylabel("Value");
legend("sin", "cos");
title("My plot");

    • 將圖表存成 png 檔於當前目錄

      print -dpng 'plot.png'

  • figure(n) : 開新視窗來展示圖表

    figure(1);
plot(t, y1);

figure(2);
plot(t, y2);

  • subplot(n, m, z) : 生成一個 n*m 的大視窗，然後目前使用第 z 個 plot

    subplot(1, 2, 1);  // 生出一個 1*2 的 grid，然後先在第一個實作 plot
plot(t, y1);

subplot(1, 2, 2);
plot(t, y2);

axis([0.5, 1, -1, 1]);  // 調整該 plot 的 x, y 軸 (x = 0.5 到 1)  (y = -1 到 1)

clf;  // clear

  • imagesc(A) : 將 matrix 添加顏色展示出來

    imagesc(A);

imagesc(A), colorbar, colormap gray;  // 多了一個 colorbar 然後把顏色用黑白呈現

補充一點 : 在 Octave 可以在單行輸入多個 sequential 指令

a = 1, b = 2, c = 3  // 會顯示

或是

a = 1; b = 2; c = 3;  // 不會顯示

Octave : Control Statements (if, for, while)

  • For loop

    v = zeros(5,1);

for i = 1 : 5
v(i) = 2^i
end

prints:
2
4
8
16
32

  • while

    i = 1;

while i <= 5
v(i) = 100
i += 1
end

prints:
100
100
100
100
100

  • if

    if v(1) == 100
disp("first element is 100")
else
disp("first element is not 100")
end

prints:
first element is 100

  • Octave 可以直接抓到當前目錄下的任何 file 中的 function

  • 我們可以透過 addpath(path) 來讓 Octave 不管在哪個 working directory 都可以抓到該目錄的 function

    addpath("C:/src/octave");

  • 文件名稱即為 function 的名稱

    • 假設我有一個 file 叫作 addTwoDigits.m，內容如下 :

      function sum = addTwoDigits(x, y)
sum = x + y;

    • 就可以在 Octave 呼叫該函數

      addTwoDigits(1, 2)
prints: 3

  • 現在我們就可以用以上所學來計算 cost function

  • 定義一個 file : costFunctionJ.m

    function J = costFunctionJ(X, y, theta)
  % X = design matrix of training sets
  % y = class labels

  m = size(X, 1);
  predictions = X*theta;
  sqrErrors = (predictions-y).^2;

  J = 1/(2*m)*sum(sqrErrors);
endfunction

  • 接著定義 training data

    X = [1 1; 1 2; 1 3];  // x0 都是 1, x1 分別是 1, 2, 3
y = [1; 2; 3];  // 這是 result
theta = [0; 1];  // 假設 theta0 不看, 只看 theta1

  • 因為會完美符合 training sets 所以 cost function 應該會是 0

    costFunctionJ(X, y, theta)
prints: 0

  • 假設把 theta1 也改成 0 (代表我全部的 prediction 都是 0)

    • 那麼 cost function 應該會是

      ((0−1)2+(0−2)2+(0−32))/2∗3 (m 值)=(1+4+9)/6=14/6=2.3333\begin{aligned} &((0-1)^2 + (0-2)^2 + (0-3^2)) / 2 * 3 \text{ (m 值)} \\ &= (1 + 4 + 9) / 6 \\ &= 14 / 6\\ &= 2.3333 \end{aligned}
      theta = [0; 0];
costFunctionJ(X, y, theta)
prints: 2.3333

Octave : Vectorization

  • Vectorization 的計算方式將會比 Unvectorization $a$ 還要快速

    • Vectorization 在底層是由一些的專家所設計，速度快

    • 所以在實作時，盡量把問題轉換為 vectorization 來解決

    • 在 C++, Java, Python 這類開發工具也應該要這麼解決

    • 計算速度更快、code 行數減少

以計算 Cost function 為例

hθ(x)=θ0x0+θ1x1+⋯+θnxnh_\theta(x) = \theta_0x_0 + \theta_1x_1 + \cdots + \theta_nx_n

  • 若使用 unvectorization 的方法來計算 :

    predication = 0.0;

for j = 1:n+1
predication += theta(j) * x(j)
end

  • 而使用 vectorization 來計算 :

    hθ(x)=∑j=0nθjxj=θTx\begin{aligned} h_\theta(x) &= \sum_{j=0}^n \theta_jx_j\\ &= \theta^Tx \end{aligned}
    predication = theta' * x

以計算 Gradient Descent 為例

  • 原公式如下 (n = 2) :

    θ0:=θ0−α1m∑i=1m(hθ(x(i))−y(i))x0(i)θ1:=θ1−α1m∑i=1m(hθ(x(i))−y(i))x1(i)θ2:=θ2−α1m∑i=1m(hθ(x(i))−y(i))x2(i)\theta_0 := \theta_0 - \alpha \frac{1}{m} \sum_{i=1}^m (h_\theta(x^{(i)}) - y^{(i)})x_0^{(i)}\\ \theta_1 := \theta_1 - \alpha \frac{1}{m} \sum_{i=1}^m (h_\theta(x^{(i)}) - y^{(i)})x_1^{(i)}\\ \theta_2 := \theta_2 - \alpha \frac{1}{m} \sum_{i=1}^m (h_\theta(x^{(i)}) - y^{(i)})x_2^{(i)}

要把他計算成 vectorization 的話，大致上要把公式弄成這樣 :

θ:=θ−αδ∣θ∈Rn+1,α∈R,δ∈Rn+1\theta := \theta - \alpha \delta \mid \theta \in \mathbb{R}^{n+1}, \alpha \in \mathbb{R}, \delta \in \mathbb{R}^{n+1}

其中

δ0=1m∑i=1m(hθ(x(i))−y(i))x0(i)δ1=1m∑i=1m(hθ(x(i))−y(i))x1(i)...δ=[δ0δ1...]\begin{aligned} \delta_0 &= \frac{1}{m}\sum_{i=1}^m (h_\theta(x^{(i)})- y^{(i)})x_0^{(i)}\\ \delta_1 &= \frac{1}{m}\sum_{i=1}^m (h_\theta(x^{(i)})- y^{(i)})x_1^{(i)} ... \\ \delta &= \begin{bmatrix} \delta_0 \\ \delta_1 \\ ... \end{bmatrix} \end{aligned}
PreviousComputing Parameters AnalyticallyNextLogistic Regression

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